В центре сюжета — Ю Наруками, который приезжает в провинциальный городок к дяде. Местная жизнь оказывается не такой скучной, как могла показаться: в городе происходят странные убийства, а главный герой вместе с друзьями получает способность призывать персоны — воплощения своей души. Вместе они расследуют преступления и ищут выход из таинственного телевизионного мира.

Действие разворачивается параллельно событиям оригинальной «Персоны 4», но добавляет и новые линии. Ключевой фигурой становится девушка по имени Мари. Первая встреча происходит случайно: она возвращает Ю улетевшее из-за ветра письмо. Позже они сталкиваются уже в Бархатной Комнате, где Маргарет просит главного героя показать Мари внешний мир — девушка страдает от потери памяти.

Именно повседневность тут выходит на первый план. Школьные будни, походы по магазинам, совместное времяпрепровождение — всё это постепенно раскрывает характеры. Мари, впервые соприкасающаяся с обычной жизнью, наблюдает за всем с любопытством и лёгкой отстранённостью, что добавляет истории особого настроения. Смотреть интересно и тем, кто знаком с первоисточником, и новичкам, хотя для полного понимания лучше хотя бы примерно знать сюжет игры.