Школьница Мирай случайно находит странный артефакт, который оказывается ключом к засекреченной лунной базе. Там она встречает загадочного парня по имени Алан, который утверждает, что знает о её происхождении больше, чем она сама. Вместе они вынуждены разобраться в череде событий, связанных с древними технологиями и экспериментами, изменившими историю человечества.

Постепенно выясняется, что школа, где учится Мирай, скрывает лаборатории и данные, способные перевернуть представление о реальности. Алан и Мирай пытаются понять, кто стоит за этими разработками и почему их жизни искусно переплетены с этими открытиями. Каждый шаг ближе к правде сопровождается новыми угрозами и неожиданными союзниками из числа тех, кто казался обычными людьми.

Фильм держится на контрасте между обычной школьной рутиной и масштабными научными загадками, которые касаются не только героев, но и всего будущего цивилизации. Сюжет концентрируется на отношениях двух подростков, которым приходится делать выбор, полагаясь только друг на друга.